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Combattere l’AIDS da casa si può, e non mi riferisco solo al fatto di poter donare soldi per la ricerca, ma fare qualcosa di più attivo. Come ? Seguitemi !
Tutti noi lasciamo il computer acceso senza utilizzarlo per minuti, in qualche caso ore, al giorno, quando rispondiamo al telefono ad esempio, oppure quando scarichiamo qualcosa da Emule (quanti di noi lo fanno, ovviamente solo per recuperare materiale lecito, si intende!). Perché non sfruttare questi tempi morti per far fare qualcosa di utile al computer ?
Si tratta di mettere i nostri computer, quando sono accesi ma non li utilizziamo attivamente, al servizio della ricerca scientifica. Come si può fare ?
Sfruttando il sistema di calcolo distribuito.
World Community Grid è un sito che raccoglie diverse ricerche, che vengono servite tutte insieme dal calcolo distribuito dei suoi utenti, e mette a disposizione un apposito programma per partecipare alle varie ricerche. Detto in poche parole esistono numerosi progetti di ricerca che necessitano di anni, pur usando i computer più potenti (e più costosi quindi), ma utilizzando il calcolo distribuito la ricerca viene scomposta in singole parti che vengono affidate ai milioni di computer sparsi nel mondo, i quali si occupano di effettuare i calcoli di base e restituire i risultati agli enti che si occupano della ricerca, attraverso il programma fornito da WorldCommunityGrid.
La rete (grid) di computer che così si viene a creare, nel complesso, garantisce un'ottima potenza di calcolo, superiore a quella di singoli super-computer. Senza il supporto di volontari che partecipino al calcolo distribuito, i tempi di ricerca si allungherebbero notevolmente, vista la complessità di alcuni calcoli necessari a studiare nel dettaglio strutture chimiche e biologiche. Spalmare queste operazioni di elaborazione su più computer, invece, alleggerisce ed accelera il tutto.
Il software di per sé non appesantisce il computer, perché è impostato in modo da lavorare in background e da non impegnare eccessivamente il processore mentre si lavora. In alternativa si può anche configurare in modo che parta solo quando non sono in corso attività sul computer (ad esempio come screen saver) oppure farlo partire solo quando si vuole, decidendo così il tempo da dedicare al calcolo distribuito. Insomma lo si può fermare quando si vuole.
Il traffico dati su internet è di pochi Kb ogni volta, con un consumo di banda trascurabile sia per le ADSL che per i 56K. Inoltre il programma si connette solo per scaricare i pacchetti e per inviare i risultati, non è connesso sempre. La maggior parte del tempo, quindi, è offline a elaborare i dati.
Come entrare in World Community Grid
Per partecipare alla community di calcolo distribuito seguite questi semplici passi:
- registratevi a World Community Grid, da questa pagina
- inserite username, indirizzo email e password, eventualmente scegliete il team di cui volete far parte (ad esempio P2PForum.it, ma non è necessario)
- mettete la spunta dove è scritto “End User Software License Agreement” e poi cliccate sul bottone Continue
- nella pagina successiva, selezionate il sistema operativo che avete installato sul vostro PC (Il software di WCG supporta sia Windows, sia OS, sia Linux) e cliccate su Continue
- a questo punto dovrebbe comparirvi una finestra di messaggio (a meno che Explorer o il browser che utilizzate non abbia bloccato la finestra come pop-up, in tal caso, cliccate sulla barra gialla che compare in cima alla schermata - se utilizzate Explorer - e scegliete Scarica file)
- salvatevi il file eseguibile sul vostro computer, poi fatelo partire (o cliccate direttamente su Esegui)
Installare il software di World Grid
Una volta scaricato il software (BOINC Manager) avviatelo, alla prima schermata cliccate su Next, in License Agreement scegliete I accept (così accettate le condizioni di uso del software), e cliccate ancora su Next. Scegliete dove installare il programma e cliccate su Next. Nella schermata successiva scegliete la velocità della vostra connessione, e poi cliccate ancora su Next due volte.
Nella nuova finestra inserite username, indirizzo e-mail e password di registrazione (le stesse che avete inserito nella registrazione al sito World Grid, nonché un nome a piacere da dare al vostro programmino (Give this Grid Agent a Name).
Se non fate uso di proxy, potete ignorare il pulsante SET Proxy. Altrimenti dovrete configurarlo.
Verificate di aver inserito i dati di registrazione giusti, e cliccate sul pulsante Login.
Adesso siete già partecipi al progetto di calcolo, infatti il programma è impostato in modo da lavorare in background, avviarsi automaticamente alla partenza di Windows e fungere anche da screensaver predefinito.
Se per diverse esigenze volete che il software entri in esecuzione solo come screensaver (ad esempio se non potete permettere che occupi le risorse quando siete davanti al PC) andate in Start -> Tutti i Programmi -> Esecuzione Automatica e rimuovete ( tasto destro mouse -> Elimina ) la voce World Community Grid Agent . Facendo questo, il client WCG Agent non partirà automaticamente all'avvio di Windows e funzionerà solo come screensaver; ovvero sarà in funzione solo quando siete lontani dal PC.
Potete inoltre, anche scegliere se far funzionare il programma tutti i giorni 24 ore su 24, o se mandarlo in esecuzione con meno frequenza. Per far questo, bisogna tornare al sito web del progetto.
Cliccate su My Grid, nella barrà di menù in alto. Inserite username e password di registrazione e premete sul pulsante Sign-in. Vi troverete di fronte alla vostra pagina World Grid personale. Nel menù a sinistra, scegliete Device Manager -> Device Profiles.
Cliccate sul link Default, sotto Profile Name. Nel rigo Days always on sono segnati i giorni in cui desiderate mantenere il programmino in funzione 24 ore su 24.
Customized days, invece, vi permette di personalizzare il tempo di esecuzione sul vostro PC del calcolo distribuito (e anche il tempo di connessione alla rete World Community Grid - è possibile variare entrambi i parametri).
Oppure, potete avviarlo solo quando lo ritenete opportuno.
La cosa da tenere a mente è che i dati elaborati dai partecipanti al progetto vanno a formare un database di informazioni ulteriormente da sviluppare (ossia, da mettere in pratica - nella creazione di farmaci, per esempio) che sarà gratuitamente disponibile a tutti gli scienziati che lavorano negli ambiti di interesse dei progetti di WCG. Insomma, chiunque - scienziato - faccia richiesta dei risultati delle ricerche di chimica computazionale elaborate tramite la rete dei computer di WCG, li avrà, senza pagare niente !
I progetti attualmente in corso sono:
- Help Cure Muscular Dystrophy (contributo alla cura della distrofia muscolare)
In questo campo di ricerca, World Community Grid sta contribuendo alla riuscita di un progetto lanciato da AFM (l'Associazione Francese per lo Studio della Distrofia Muscolare), CNRS (il centro nazionale francese per la ricerca scientifica) e IBM (che ha donato sia il software che l’hardware per il progetto). Il progetto consiste nello studio computazionale delle interazioni tra le 40000 proteine di cui si conosce già la struttura tridimensionale, con un'attenzione particolare alle proteine coinvolte nelle malattie neuro-muscolari come la distrofia.
Molte delle malattie neuro-muscolari sono dovute a mutazioni genetiche, che comportano mutazioni proteiche: tali mutazioni portano a proteine che non funzionano più, che funzionano male o all'eliminazione di alcune di esse.
Per far capire nel dettaglio ai ricercatori come le malattie neuro-muscolari impediscano alle proteine di svolgere la loro funzione di mantenimento della salute muscolare e nervosa, è necessaria una più accurata comprensione delle interazioni tra le proteine coinvolte nella distrofia muscolare. Conoscere nel dettaglio la funzione e le interazioni delle proteine è fondamentale anche per aiutare i ricercatori a impostare strategie terapeutiche. Una conoscenza del genere è favorita e accelerata da programmi di biochimica computazionale come quello cui partecipa World Community Grid. Senza questa conoscenza fondamentale, gli scienziati avranno difficoltà a trovare terapie innovative per un trattamento più specifico ed efficace della maggior parte delle malattie neuromuscolari.
Human Proteome Folding - Phase 2 (Piegamento del proteoma umano - seconda fase)
La prima fase del progetto Human Proteome Folding si era conclusa, con successo, nel luglio del 2006 con l'individuazione della struttura di molte proteine ancora poco conosciute, e la conseguente possibilità di predire le loro funzioni principali. Adesso è attiva la seconda fase di quel progetto, che si propone di migliorare la risoluzione delle strutture proteiche trovate, concentrandosi in particolar modo sulle proteine patogene. Trovare una composizione atomica più precisa di queste strutture molecolari consente, tra le altre cose, di sintetizzare farmaci più efficaci (perché più "mirati") per delle malattie legate alla codifica di determinate proteine patogene.
FightAIDS@Home (Combatti l'AIDS da casa)
Questo programma, sviluppato dallo Scripps Research Institute, si propone di studiare modi computazionali per trovare nuovi farmaci anti-HIV, trovando le molecole più adatte ad inibire il virus. In particolare, si cerca di trovare la molecole capace di inibire la proteasi dell'HIV, quel meccanismo molecolare che ne regola il ciclo replicativo.
Una volta trovata la struttura tridimensionale più adeguata, gli scienziati potranno sintetizzarla in laboratorio per creare una nuova, più funzionale cura all'AIDS, bloccandone la manifestazione e prolungando la vita di chi ne è colpito.
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